La bandeja del sistema o system tray de Debian 12 no viene activa por defecto y las aplicaciones como Telegram, aMule o cualesquiera que se queden abiertas en segundo plano, no son visibles desde el escritorio.
Esto lo solucionamos instalando la extensión Ubuntu AppIndicators en GNOME Shell.
Esta extensión integra Ubuntu AppIndicators y KStatusNotifierItems (el bendito sucesor de la bandeja del sistema de KDE) en GNOME Shell.
En una terminal ejecutamos el siguiente código.
sudo apt install gnome-shell-extension-appindicator
Cierra y vuelve a iniciar sesión.
En el menú principal busca la aplicación llamada extensiones.
Ahora dentro de la aplicación extensiones habilita la extensión Ubuntu AppIndicators
Una vez que esté habilitada será visibles los iconos de las aplicaciones que tienen habilitado el icono en la bandeja del sistema.
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